Die Geschichte der HYDRA-Handelsmarineschule beginnt im Jahr 1749, als die gleichnamige Schule innerhalb der Mauern der Kirche von Agios Vasilios gegründet wurde und im Jahr 1800 auf Beschluss der Würdenträger in die „Hydra-Marineschule“ umgewandelt wurde “. Die Insel verdankt viel der Schule, in der die Seeleute ausgebildet wurden, die während des Unabhängigkeitskampfes arbeiteten.
Bedeutende italienische und portugiesische Lehrer reisten hier durch und unterrichteten nicht nur Seefahrtskunst und -theorie, sondern auch Fremdsprachen. Tatsächlich liebte einer von ihnen, der Sizilianer Felice Caserta, den Ort so sehr, dass er während des Unabhängigkeitskampfes bei der Besatzung eines Hydraulikschiffs half. Der Betrieb der Schule wurde auch nach der Revolution fortgesetzt.
Es ist seit 1930 öffentlich und befindet sich in einem Gebäude aus dem späten 18. Jahrhundert, das Athanasios Koulouras und Anastasios Tsamados gehörte.