Das Schutzgebiet von 2093,98 Hektar umfasst den gesamten Nationalpark Schinias und eine weitere Randzone. Das Gebiet liegt im nordöstlichen Teil von Attika, 40 km von Athen entfernt, in der Ebene von Marathon und wird im Nordosten von den Mittelgebirgen Karoubalo, Pounta und Drakonera umgeben. Der zentrale Teil des Gebiets wird von den Überresten des ehemals ausgedehnten Feuchtgebiets von Marathon eingenommen, das seit 1923 von Entwässerungsarbeiten heimgesucht wird.
Die leicht brackige Quelle Drakonera, die sich am Fuße des Drakonera-Hügels befindet, hat derzeit eine verringerte Fließgeschwindigkeit, die nur in feuchten Perioden sichtbar ist. Im südlichen Teil erstreckt sich eine sandige Küstenzone von Osten nach Westen, und die Halbinsel Kynosoura begrenzt den südöstlichen Teil. In einem länglichen Bereich in der Nähe der Makaria-Quelle, der sich im westlichen Teil des Feuchtgebiets über eine Gesamtfläche von 450 Hektar erstreckt, befand sich bis 2004 ein kleiner Flughafen. Im Jahr 2004 wurde das olympische Ruderstadion auf dem Gelände des ehemaligen Flughafens errichtet. Im zentralen Teil des Feuchtgebiets befand sich mehrere Jahre lang eine 100 Hektar große US-Militärkommunikationsbasis. Das Küstengebiet von Schinias besteht aus Sanddünen aus dem Holozän. Im Norden ist das Sumpfgebiet von lehmigen und teilweise sandigen Schwemmablagerungen gleichen Alters bedeckt. Im Osten bestehen die Hügel von Mytikas und Drakonera aus dem oberkreidezeitlichen Marmor von Agia Marina, der örtlich von Schlacken und Schuttkegeln bedeckt ist.
Das Gebiet gehört zur größeren geografischen Region Attika und weist die gleichen typischen klimatischen Bedingungen auf. Das Klima ist mediterran, mit trocken-warmen Sommern und milden, regnerischen Wintern. Die durchschnittliche jährliche Lufttemperatur liegt zwischen 16,5°C und 19°C. Der kälteste Monat des Jahres ist der Januar, während die wärmsten Monate Juli und August sind. Die durchschnittliche jährliche Niederschlagsmenge liegt bei 378 mm, die Luftfeuchtigkeit beträgt zwischen 59 % und 64 %. Bewölkte Tage gibt es im Durchschnitt etwa 50 pro Jahr, während sonnige Tage im Durchschnitt etwa 130 sind, was insgesamt 2.920 Sonnenstunden pro Jahr ergibt.
Vor 1923 versorgte der Abfluss der Makaria- und der Drakonera-Quelle das Feuchtgebiet mit leicht brackigem Wasser, das dann über den nahe der Ostküste des Gebiets entstandenen Stomi-See ins Meer geleitet wurde. Es wird geschätzt, dass allein die Makaria-Quelle das Feuchtgebiet jährlich mit 6-7 Millionen Kubikmetern Wasser versorgt. Eine weitere Wasserquelle waren die Abflüsse aus dem vorgelagerten Gebirgseinzugsgebiet. Um das Sumpfgebiet in landwirtschaftliche Nutzflächen umzuwandeln, wurde 1923 ein Entwässerungskanal entlang der westlichen Grenze des Gebiets gebaut. Dieser Kanal führte die Gewässer von Makaria direkt zum Meer. Anschließend wurde ein Netz von Hochwasserschutz- und Entwässerungskanälen flussaufwärts des Feuchtgebiets angelegt, die das Hochwasser ebenfalls direkt zum Meer führten. In dieses Netz wurden in den 1960er und 1970er Jahren sekundäre Hochwasserschutzkanäle und Entwässerungskanäle eingefügt, um die Militäreinrichtungen und den Flughafen zu schützen, die in der Zwischenzeit innerhalb des Feuchtgebiets errichtet worden waren. Infolgedessen beschränkte sich die Süßwasserversorgung des Feuchtgebiets auf die Niederschläge, die das Überschwemmungsgebiet erhielt (etwa 0,7 Millionen Kubikmeter Wasser pro Jahr), während gleichzeitig erhebliche Mengen an Meerwasser sowohl aus dem Untergrund als auch über die Oberflächenverbindung des Stomi-Sees zugeführt wurden. Infolgedessen wurde die permanente Salzwiese von Stomi in einen saisonalen See umgewandelt, und die Fläche des Feuchtgebiets schrumpfte aufgrund der Trockenheit und der anschließenden Landgewinnungsarbeiten erheblich. Das Feuchtgebiet wurde während der Regenzeit überflutet und trocknete im Sommer aus. Der Salzgehalt war unterschiedlich, wobei in den meisten Teilen des Flusses salziges oder brackiges Wasser vorherrschte und das frische oder leicht brackige Element auf ein kleines Gebiet um die Makaria-Quelle, entlang eines Entwässerungsgrabens westlich des Draconera-Hügels und in geringerem Maße entlang anderer Entwässerungskanäle beschränkt war. Die oben beschriebene hydrologische Situation und die Veränderungen in der Landnutzung haben den früheren Zustand des Lebensraumtyps Feuchtgebiet geprägt und die sandige Küstenzone des Gebiets beeinflusst.
Wie bereits erwähnt, wurde 2004 das olympische Ruderstadion auf dem Gelände des ehemaligen Flughafens errichtet. Innerhalb des olympischen Ruderzentrums wurden zwei künstliche Wasserflächen angelegt. Das Wasser aus der Makaria-Quelle wird über Wasserbauwerke in die Wasserkörper des Olympia-Komplexes geleitet und dann in das zentrale Feuchtgebiet abgeleitet. Darüber hinaus wurden folgende Maßnahmen durchgeführt: die Beseitigung der Flughafenstrukturen und der Start- und Landebahn, die Beseitigung der inaktiven Militäranlage und die Entschärfung des Bodens in dem Gebiet, die Beseitigung eines ausgedehnten Netzes von Antennenträgern für die Telekommunikation, die den Lebensraum zerstückeln und die Tierwelt stark beeinträchtigen. Der Bau des Olympia-Komplexes und die ständige Präsenz von zwei Gewässern, die Süß- und Brackwasser in das Feuchtgebiet leiten, haben sich positiv auf die biologische Vielfalt des Nationalparks ausgewirkt. Mindestens fünfunddreißig Vogelarten wurden begünstigt, darunter die streng geschützte Aythya nyroca.
Außerdem ist festzustellen, dass sich die Oberfläche des Schilfs deutlich vergrößert hat. Die halophytische Vegetation nimmt den zentralen und größten Teil des Feuchtgebiets ein, was auf die intensiven Entwässerungsmaßnahmen und den Druck des Menschen auf das Gebiet in den letzten 80 Jahren zurückzuführen ist. Die halophytischen gemeinschaften bilden oft Mosaike: Salzwiesen mit Juncus (Lebensraumtyp 1410) und Salzsträuchern sind gemischt und gehen in der Nähe des Stomi-Sees in Glasgräser (Lebensraumtyp 1420) über, wo sich die Vegetation auf einem Substrat aus sich zersetzenden Seegräsern (hauptsächlich Posidonia oceanica) ansiedelt. Juncus maritimus ist die vorherrschende Art, andere charakteristische Arten sind Juncus heldreichianus, Limonium narbonense, Aster tripolium, Scirpoides holoshoenus, Scirpus littoralis, Bolboschoenus maritimus (=Scirpus maritimus), Puccinelia distans, Plantago crassifolia. Die Hauptvegetationsart sind Salzbüsche, die von Sarcocornia perennis (in niedrigeren Lagen) und Arthrocnemum macrostachyum (in höher gelegenen, besser durchlüfteten Gebieten) dominiert werden. Andere Arten sind die Puccinelia festuciformis, P. distans, Limoniun narbonense, L. virgatum, L. bellidifolium, Centaurium spicatum, Suaeda vera, Salsola soda und Atriplex portucaloides. Einjährige halophile Pioniergesellschaften (Lebensraumtyp 1310) mit Cressa cretica wachsen entlang trockener Kanäle und manchmal in Abschnitten mit erhöhtem Salzgehalt, die länger überflutet bleiben.
Andere Saginetea-Arten, wie Spergularia salina, Parapholis incurve, P. filiformis, Salsola soda, kommen unter den Salzsträuchern vor, bilden aber nur selten repräsentative Gemeinschaften. Schilfgürtelaus Phragmites australis und Typha angustifolia (Corine 53.1) nehmen vor allem Teile des zentralen und nordwestlichen Teils des Feuchtgebiets ein, mit Anzeichen für eine Ausdehnung. Tamariskenhütten (Lebensraumtyp 92D0) wachsen an den Ufern von Kanälen und Deichen im gesamten Feuchtgebiet, insbesondere im Hauptkanal der Makaria-Quelle mit Tamarix tetrandra (hauptsächlich im östlichen Teil) und Tamarix hampeana (hauptsächlich im westlichen Teil). Diese beiden Lebensräume bilden ein Mosaik im nordwestlichen Teil des Gebietes. An der Makaria-Quelle und entlang des Abflusskanals entstehen aquatische Süßwasserlebensräume. Magnopatamion-Vegetation mit Potamogeton nodosus (Lebensraumtyp 3150) kommt in den Pfützen des kleinen Teiches vor, der an der Makaria-Quelle angelegt wurde.
Entlang des Kanals, an Stellen mit langsamer Strömung, gibt es schwimmende Gemeinschaften von Apion nodiflori (Lebensraumtyp 3260) mit einer benthischen Chara-Schicht (Lebensraumtyp 3140 ist in 3260 enthalten). In der Nähe der Mündung ist die Strömung nicht dauerhaft und es wachsen dort Gemeinschaften von Potamogeton pectinatus und Nasturtium officinale (Lebensraum 3290). Typische Lebensgemeinschaften des Lebensraums “Mediterrane saisonale Teiche (Lebensraumtyp 3170)” wurden in dem Feuchtgebiet nicht festgestellt. Ein einziger kleiner Fleck mit einjährigen Zwergpionierpflanzen, charakterisiert durch Crassula sp. und Herniaria hirsute, wurde an einem Straßenrand (südwestlicher Teil des Geländes) auf einem sandigen, zeitweise wassergesättigten Substrat festgestellt. Außerdem wachsen kleine Gemeinschaften von Juncus bufonius, Poa annua, Plantago coronopus in kleinen temporären Teichen zwischen Wacholder-Matorral in den unteren Teilen des Dracona. Diese Gemeinschaften, an denen Isoeto-NanoJuncetea-Arten beteiligt sind, könnten auf vegetative Lebensräume (wie Juncus articulatus, Mentha pulegium, Serapias lingua, Centaurium pulchellum, Lotus angustissimus) zurückgeführt werden, die aus dem Gebiet gemeldet wurden. Der sandige Teil des Geländes an der Küste enthält aufeinander folgende Zonen mit sandigen Lebensräumen. In einer Zone 50 m vom Meer entfernt gibt es nur nackten Sand mit lockeren Treibgesellschaften von Cakile maritime, Matthiola tricuspidata, Salsola kali (Lebensraumtyp 1210), gefolgt von Kämmen aus niedrigen embryonalen Sanddünen (Lebensraumtyp 2110) mit Elytrigia juncea (=Elymus farctus), Eryngium maritimum, Medicago marina. Pseudorlaya pumila, Lotus halophilus, Allium staticiforme, Rhagadiolus stellatus, Silene colarara sind ebenfalls an den sandigen Gemeinschaften zu finden. Im westlichen Teil, näher an der Mündung des Makaria-Kanals und vor dem Wohngebiet des Parks, ist die Sanddünenstruktur noch stärker degradiert. Es gibt Sanddünengemeinschaften mit Cyperus capitatus und Sporobolus pungens und eine niedrige Dünenfront mit Centaurea spinosa. Hinter dieser Zone und entlang der gesamten Küste befinden sich niedrige, stabilisierte Sanddünen, die im westlichen Teil mit Pinus pinea und im östlichen Teil mit Pinus halepensis bewaldet sind (die beiden Kiefern sind in der Mitte gemischt).
Geschichtlich bestand sie aus Macchia-Arten, hauptsächlich Pistacia lentiscus und auch Quercus coccifera, Juniperus phoenicea, Myrtus communis, Rhamnus alaternus, Rubia peregrine, Ruscus aculeatus, Smilax aspera, Asparagus acutifolius und aus gerösteten Arten wie Helichrysum stoechas, Phagnalon graecum, Anthyllis hermaniae, Cistus incanus, C. salvifolius, Coridothymus capitatus. Die Pflanzenschicht umfasst Arten wie Cyclamen hederifolium, C. graecum, Ophrys lutea, Serapias lingua. Eine Zone im nördlichen Teil des Pinus-Pinea-Waldes ist von einem niedrigen bis mittelhohen Matorral bedeckt, der von Pistacia lentiscus (Lebensraumtyp 2260) dominiert wird. Einjährige Malcolmietalia-Grasflächen (Lebensraumtyp 2230), hauptsächlich Silene colorata, Anthemis tomentosa und Medicago littoralis, wachsen hauptsächlich in ausgedehnten Flecken auf dem überwiegend flachen, stabilisierten Sand der hinteren Sanddüne im westlichen Teil des Standorts. In der am meisten gestörten Zone zum Feuchtgebiet hin wächst das Stellarietea mediae-Grasland auf Kosten des typischen Sanddünen-Graslands. Isolierte Juniperus oxycedrus ssp. An diesen Stellen wachsen Macrocarpa und kleine Bestände von Pinus pinea. Es sei darauf hingewiesen, dass die Malcolmietalia-Dünenrasen (2230) des Standorts, die zur Ordnung der Thero-Brachypodietea gehören, zuvor als Lebensraumtyp 6220 klassifiziert wurden, der eine ähnliche floristische Zusammensetzung aufweist. Da diese Gemeinschaften jedoch Teil des Dünensystems sind, lassen sie sich am besten als Lebensraumtyp 2230 beschreiben. In einer schmalen Zone zwischen den Sanddünen und dem Wald gibt es kleine Bestände von Juniperus oxycedrus ssp. macrocarpa (Lebensraumtyp 2250) mit Pistacia lentiscus. Pistacia lentiscus-Formationen in Sanddünen bilden den Lebensraumtyp 2260. Bei diesen Formationen handelt es sich wahrscheinlich um Überreste früherer, gut entwickelter postdänischer Gemeinschaften, wie man sie auch anderswo in der Ägäis findet.
Die Halbinsel Kynosoura ist größtenteils von langen, mittelhohen bis hohen, stellenweise verstreuten, aber im Allgemeinen recht dichten Wäldern bedeckt. Vorwiegend gibt es Juniperus phoenicea (Lebensraumtyp 5210) in den meisten Beständen, während andere Sträucher wie Pistacia lentiscus, P. terebinthus, Ceratonia siliqua, Olea europaea ssp. oleaster, Ephedra foemina, Quercus coccifera, Rhamnus alaternus, Calicotome villosa, Prunus webbii, Prasium majus anwesend sind. Die Krautschicht und die Öffnungen beherbergen eine Vielzahl von Thymophyten, Gräsern und Geophyten, darunter die endemischen Fritillaria obliqua und Scorzonera crocifolia, sowie einige Orchideen. Phryganas Satureja Juliana, S. nervosa, S. graeca, Euphorbia acanthothamnos, H. stoechas, Phagnalon graecum, Coridothymus capitatus, Teucrium capitatum, T. divaricatum wachsen im Unterteil und in den Öffnungen der Macchia hauptsächlich im westlichen Teil. An offenen felsigen Stellen mit Felsbrocken, auf der Spitze des Kaps und an einigen Hängen dominiert der Strauch Euphorbia dendroides, der zusammen mit Anagyris foetida, Phlomis fruticosa, Ephedra foemina wächst. An denselben Standorten wachsen in Felsspalten kleine Gemeinschaften von Asplenium cetarach, Cheilanthes acrostica, Cosentinia vellea, Umbilicus rupestris. Die Büsche hängen die steilen Hänge über dem Meer hinunter.
Der Dracona Hill ist auch mit Wacholder bewachsen, der eine ähnliche Zusammensetzung aufweist, aber im Allgemeinen dünner und niedriger ist (aufgrund von Bränden und Beweidung in jüngster Zeit). Die repräsentative Grasvegetation wächst auf einem kleinen Felsen auf der Spitze des Hügels. Wildgraswiesen (Thero-Brachypodietea, Lebensraumtyp 6220) wachsen in den Öffnungen der Büsche, aber auf den flachen Flächen der Vorgebirge werden sie von Stellarietea- und Artemisetea-Arten übernommen. Das Feuchtgebiet von Schinias ist seit jeher eine wichtige Durchzugsstation für Wasservögel und andere Wasservögel. Zu den Besuchern gehören Plegadis falcinellus, Botaurus stellaris, mehrere Arten von Ardeidae, Rallidae, Ciconiidae, Anatidae, Tringa, Calidris sowie zahlreiche Raubvögel (hauptsächlich Falconidae). Die Bedeutung des Gebietes wurde durch die oben erwähnten Eingriffe in das Wasserregime aufgewertet. Die Wintervogelfauna umfasst u. a. den geschützten Acrocephalus melanopogon.
Auch wenn die Zahl der Raubvögel gering ist, ist das Vorkommen mehrerer Arten in den umliegenden Hügeln von Bedeutung. Zu diesen Arten, die das Feuchtgebiet bewohnen, gehören unter anderem Circaetus gallicus, Buteo rufinus, Falco peregrinus, Bubo bubo sowie die häufigeren Arten Buteo buteo, Falco tinunculus, Tyto alba und Otus scops. In der langen, die Hänge bedeckenden Vegetation wachsen geschützte Arten, die für diesen Lebensraumtyp typisch sind, wie Sylvia hortensis und Sylvia rueppelli. Entlang des Kanals und der Seen findet man an den Ufern die Reptilien Emys orbicularis, Mauremys caspica, Testudo hermanni, Testudo marginata, Elaphe situla sowie den endemischen Fisch Pelasgus marathonicus.
Das Feuchtgebiet von Schinias ist das größte Küstenfeuchtgebiet in Attika und eines der größten in Ostgriechenland. Das Gebiet ist ein wichtiger Zwischenstopp während des Frühjahrs- und Herbstzuges, wenn Tausende von Vögeln zu ihren Sommer- bzw. Winterquartieren ziehen. Im Frühjahr ruhen sich viele Watvogelarten aus, tanken auf und suchen Schutz in den Sümpfen.
Im Rahmen der Habitat- und der Vogelschutzrichtlinie der Europäischen Union stehen 102 Arten, die meisten davon Vögel, unter Schutz.