Le musée archéologique de Marathon est situé à Vrana de Marathon, sur un terrain exproprié par le ministère de la Culture, qui comprend également le cimetière abrité de l’âge du bronze moyen (2000-1600 av. J.-C.) et la tombe dite des Platéens du Ve siècle av. J.-C..
L’exposition est répartie dans cinq salles et dans l’atrium couvert. Elle présente des pièces datant du néolithique jusqu’à la fin de la période romaine.