Το μουσείο στην πραγματικότητα είναι τμήμα του Λυκείου Ελληνίδων και η συλλογή των ενδυμασιών και όλο του ενδυματολογικού υλικού ξεκίνησε από την ίδια την ιδρύτρια του Λυκείου Καλλιρρόη Παρρέν.
Στον Κεραμεικό, στην καρδιά της αρχαίας Αθήνας, αυτό το μουσείο περιλαμβάνει στις μόνιμες συλλογές του αντικείμενα και έργα τέχνης από στρατόπεδα πολιτικών κρατούμενων και τόπων εξορίας από όλη την Ελλάδα.
Το Μουσείο Ελληνικών Λαϊκών Μουσικών Οργάνων «Φοίβος Ανωγειανάκης» ή αλλιώς Κέντρο Εθνομουσικολογίας όπως είναι το επίσημο όνομά του είναι στην Οδό Διογένους, στην Πλάκα.
Το Εβραϊκό Μουσείο της Ελλάδος ιδρύθηκε το 1977 από την Ισραηλιτική κοινότητα των Αθηνών και στεγάστηκε σε ένα δωμάτιο της Συναγωγής στην οδό Μελιδώνη.