Το Αρχαιολογικό Μουσείο Κεραμεικού βρίσκεται στον ίδιο χώρο με τον Αρχαιολογικό Χώρο Κεραμεικού, κοντά στην είσοδό του από την Οδό Ερμού. Η αρχική συλλογή του αποτελούνταν αποκλειστικά από ευρήματα της περιοχής, που ήρθαν στο φως από τις πρώτες ανασκαφές το 1863. Μέχρι τότε τα ευρήματα φυλάσσονταν σε διάφορα μικρά κτίρια.
Πολύ αργότερα, τη δεκαετία του 1930, κτίστηκε ένα νέο, σύγχρονο κτίσμα, ορθογώνιο και λιτό, το οποίο χρηματοδοτήθηκε και σχεδιάστηκε από το Γερμανικό Αρχαιολογικό Ινστιτούτο. Στις αρχές του αιώνα, το μουσείο ανακαινίστηκε πλήρως και αρκετό από το χαμένο υλικό του επανακτήθηκε, χάρη στις σύγχρονες αντιλήψεις σε θέματα κυριότητας ευρημάτων των μουσείων.
Κατά τη διάρκεια της ανακαίνισης επισκευάστηκε, συντηρήθηκε και εκσυγχρονίστηκε η αίθουσα του παλαιού μουσείου. Επίσης, προστέθηκε ακόμα ένας χώρος για εκθέσεις, η εσωτερική αυλή που μεταμορφώθηκε κυριολεκτικά μετά τις επεμβάσεις στο χώρο της και στην οροφή.
Έτσι, σήμερα, το μουσείο διαθέτει τρεις αίθουσες-εκθεσιακούς χώρους, οι οποίες περικλείουν ένα μικρό εκθεσιακό χώρο, τον εσωτερικό κήπο με τις δάφνες και τις ελιές.
Πιο αναλυτικά, στην αίθουσα 1 εκτίθενται τα γλυπτά που βρέθηκαν στο χώρο του Κεραμεικού και χρονολογούνται απ’ όλες τις εποχές της αρχαιότητας. Και στις αίθουσες 2 και 4 εκτίθεται μεγάλος αριθμός κεραμικών, κυρίως από το νεκροταφείο του Κεραμεικού.
