Στις πλαγιές του βουνού Σταυρός, μέσα στο πευκοδάσος, και με ακριβώς δίπλα της τον ναΐσκο του Αγίου Ιωάννη του Καλυβίτη από τον 10ο αιώνα. Στο κωδωνοστάσιό της υπάρχει επιγραφή με χαραγμένη τη χρονολογία 1742, αλλά δεν είναι γνωστό αν πρόκειται για χρονιά ανακαίνισης ή ίδρυσης της μονής.
Η εκκλησία είναι αρχιτεκτονικού ρυθμού μονόκλιτος βασιλική, η τοιχοδομή της αποτελείται από μεγάλες πέτρες και διαθέτει δύο πύλες. Έχει απλές αγιογραφίες, έργα του ντόπιου αγιογράφου Νικολάου Αδριανού.
Κατά τη διάρκεια της Τουρκοκρατίας και της Επανάστασης του 1821 στη Μονή του Αγίου Νικολάου των Λεμονιών έβρισκαν καταφύγιο καταδιωγμένοι αγωνιστές αλλά και άνθρωποι που προσπαθούσαν να αποφύγουν τον τουρκικό στρατό. Αργότερα, κατά τους χρόνους του Όθωνα, εγκαταλείφθηκε. Επαναλειτούργησε το 1966, ως μονή για γυναίκες αυτή τη φορά.
Στη Μονή φυλάσσονται σήμερα τέσσερις φορητές εικόνες του 18ου αιώνα, έργα του Αθηναίου αγιογράφου Ιωάννου Αθανασίου.
