Το μουσείο περιβάλλεται από αγροτική γη μεγάλης έκτασης, μέσα στην οποία υπάρχουν ο Τύμβος των Νεκρών Πλαταιών και ένα νεκροταφείο των Μεσοελλαδικών Χρόνων.
Διαθέτει πέντε αίθουσες ως εκθεσιακούς χώρους, αίθριο και υπόγειο με αποθήκες για τη φύλαξη και προστασία ευρημάτων.
Τα εκθέματά του προέρχονται από αρχαιολογικές ανασκαφές στην ευρύτερη περιοχή και περιλαμβάνουν ευρήματα από τους Νεολιθικούς Χρόνους έως την Υστερορωμαϊκή Εποχή.
Όλα τους παρουσιάζονται με θεαματικό τρόπο, αλλά αυτά που τραβούν την προσοχή και έχουν μεγαλύτερη ιστορική αξία είναι εκείνα από τον Τύμβο των Αθηναίων και από τα προϊστορικά νεκροταφεία.
Το μουσείο κτίστηκε μόλις το 1975 στη θέση Βρανάς κοντά στον Μαραθώνα και ανακαινίστηκε πλήρως το 1994.