Ο μικρός Ναός του Αγίου Ελισσαίου είναι μια λιτή μονόκλιτη βασιλική μικρού μεγέθους. Κτίστηκε περίπου στα μέσα του 17ου αιώνα, μέσα στον κήπο του αρχοντικού της γνωστής οικογένειας της Αθήνας Χωματιανού-Λογοθέτη.

Στα τέλη του 19ου και στις αρχές του 20ου αιώνα, ο μικρός και άσημος αυτός ναός φιλοξένησε μερικούς από τους λαμπρότερους εκπροσώπους των γραμμάτων της εποχής. Άλλους ως ψάλτες, όπως ο Αλέξανδρος Παπαδιαμάντης και ο Αλέξανδρος Μωραϊτίνης, άλλους ως ιερείς, όπως ο πατέρας Νικόλαος Πλανάς, αργότερα Άγιος της Ορθόδοξης Εκκλησίας, και άλλους ως πιστούς που παρακολουθούσαν τη λειτουργία.

Το 2004 και με τη βοήθεια ευρημάτων από τις ανασκαφές, στο χώρο αναστηλώθηκαν ορισμένα από τα κατεστραμμένα τμήματα και έτσι ο ναός επί της Οδού Άρεως στο Μοναστηράκι αποκαταστάθηκε σε μεγάλο βαθμό.