La création du musée de la culture grecque moderne en 1918, sous le nom de « musée de l’artisanat grec », était directement liée à une série d’initiatives et de développements qui ont eu lieu dans la vie intellectuelle et politique du pays au tournant des 19e et 20e siècles. À une époque où la question nationale était à l’ordre du jour et où il était impératif de prouver la continuité intemporelle de la culture grecque, le nouveau musée visait à combler une lacune chronologique spécifique dans cette prétendue continuité, à savoir la période allant de la chute de Constantinople à la fondation du nouvel État grec.
Le poète Georgios Drosinis, qui dirigeait alors le département des lettres et des arts du ministère de l’éducation ecclésiastique et publique, était l’un des membres fondateurs du musée. Représentant éminent de la génération des années 1880, riche d’une œuvre littéraire et sociale, il a été fortement influencé par Nikolaos Politis et son orientation vers l’étude de la culture populaire Pour une meilleure organisation du musée, un comité administratif a été créé, composé d’archéologues, de personnalités littéraires et artistiques et de représentants d’associations s’occupant d’artisanat. Le peintre Konstantinos Maleas est nommé premier directeur.
Le musée est installé dans la mosquée de la Fontaine inférieure ou mosquée Tzistarakis, construite en 1759. La mosquée Tzistarakis était le lieu d’exposition de la collection, qui comprenait des objets d’art populaire et d’usage quotidien, couvrant la période de l’occupation turque et provenant non seulement de Grèce, mais aussi de toutes les régions habitées par des Grecs.
La collection du nouveau musée a été constituée grâce à des achats et à des dons. Pendant cette période, les antiquaires et les colporteurs du genre, tant grecs qu’étrangers, ont été les principaux fournisseurs de son enrichissement. Le principal critère de sélection des objets collectés était leur valeur artistique et esthétique et leur caractère unique.
En 1923, le musée de l’artisanat grec a été rebaptisé « musée national des arts décoratifs ». Jusqu’en 1926, Georgios Drosinis en prend personnellement la direction. Son objectif devient alors « la création d’un art national du bijou ». Le musée rassemble désormais des objets de l’Antiquité à des époques plus récentes afin d’attester de la continuité de l’art grec. Parallèlement, de nombreux représentants de la tendance de l’entre-deux-guerres à l’exploitation de la tradition, tels qu’Angeliki Hadjimichali, Aristote Zachos, Dimitris Pikionis, etc. ont contribué de manière décisive au développement du musée. En 1931, le musée, s’inspirant de musées européens similaires, a été rebaptisé « Musée d’art populaire grec », mais en 1935, il est revenu aux objectifs et au contenu de son ancien nom. Avec la déclaration de la Seconde Guerre mondiale, le musée a été fermé et ses expositions ont été transférées au Musée archéologique national, où elles sont restées pendant de nombreuses années. En 1956, la réorganisation et la période principale du développement du musée ont commencé. Au début de l’année 1958, le musée a ouvert ses portes au public et, en 1959, il a de nouveau changé de nom : Il est rebaptisé « Musée d’art populaire grec ».
Durant cette période, le musée cristallise sa physionomie et le contenu de ses collections.
À la fin des années 1960, la mosquée ne peut plus répondre aux exigences d’exposition d’un musée en constante évolution. En 1973, l’exposition principale a été transférée dans le bâtiment situé au 17 de la rue Kydathenaion. La mosquée Tzistarakis est restée en activité, abritant l’exposition de céramiques grecques modernes, avec des objets provenant de l’importante donation de la collection Vassilis Kyriazopoulos. Une nouvelle période d’expansion a alors commencé pour le musée, puisque le bain de l’Aeres (1998), la maison du 22 rue Panos (2003) et le musée des instruments de musique populaires grecs – collection de Phoebos Anogeianakis (2014) ont été progressivement ajoutés en tant que satellites à l’exposition principale.
Au cours des dernières décennies, le musée s’est progressivement orienté vers la documentation de la culture traditionnelle, y compris ses influences, ses discontinuités et l’enregistrement des éléments de la vie matérielle quotidienne. L’orientation actuelle de la politique de collection du musée et de son approche documentaire et interprétative a nécessité un changement de nom.
Depuis 2018, il s’appelle désormais le Musée de la culture grecque moderne.. L’exposition permanente centrale du musée au 17 rue Kydathenaion et la mosquée Tzistarakis ont cessé de fonctionner en 2014, dans le cadre des travaux d’aménagement du nouveau musée dans le bloc des rues Areos-Kladou-Vrisakiou et Adrianou. Une nouvelle période de l’histoire du musée commence.